上海市北郊学校由原虹口区大连新村小学、原上海市甘霖中学、原曲阳中学、四平中学撤并重组而成。
上海市北郊学校由原虹口区大连新村小学、原上海市甘霖中学、原曲阳中学撤并重组而成。集中了三校优良传统，荟萃了三校的人才和资源，使北郊学校不仅成为虹口区规模最大的学校之一，而且依托北郊中学的良好声誉和校园文化，今天的北郊学校已因质量高、服务优而享誉虹口。
原大连新村小学创建于1958年，创办之初承担着中心小学的任务，属小教第四学区，向周边十几所小学发挥示范辐射作用。80年代中期，因其他新兴学校崛起和校舍陈旧等原因，学校声誉有所下降。
原甘霖中学创建于1963年，开办时为完全中学，师资力量较强。80年代中期，高考成绩在虹口区小有影响。1985年起停止高中招生，开设“电子”和“海关”等专业的高中职业班，海关班成为社会公认的重点专业。1992年职业班并入统计职校，甘霖中学成为一所公办初级中学。
为进一步提高两校的办学质量和效益，改善学校的社会声誉，1997年8月虹口区政府和区教育局作出“依托北郊，重做发展”的决定，将两校撤并重组为上海市北郊学校。
2001年9月，因曲阳中学原址兴办“新北郊初级中学”，原曲阳中学并入我校，使北郊学校成为虹口区规模最大的九年一贯制学校。
2013年9月，上海市四平中学并入我校，将七至九年级学生全部迁移至我校。
